| | SLO | ENG | Piškotki in zasebnost

Večja pisava | Manjša pisava

Izpis gradiva Pomoč

Naslov:Iskanje novih zaviralcev, ki preprečujejo vezavo SARS-CoV-2 na neuropilin 1 : magistrsko delo
Avtorji:ID Serianz, Zala (Avtor)
ID Bren, Urban (Mentor) Več o mentorju... Novo okno
ID Kolarič, Anja (Komentor)
Datoteke:.pdf MAG_Serianz_Zala_2023.pdf (5,32 MB)
MD5: 5D3E6E0F7A1A6179871F88E05831FEDD
 
Jezik:Slovenski jezik
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga
Tipologija:2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
Opis:Neuropilin 1 je eden najpomembnejših koreceptorjev vaskularnega endotelijskega rastnega faktorja A. Vključen je v številne fiziološke in patološke procese, med drugim sodeluje pri vezavi virusa SARS-CoV-2. Zaradi nujne potrebe po inovativnih strategijah boja proti virusu SARS-CoV-2 je magistrsko delo usmerjeno na računalniško pot odkrivanja potencialnih zaviralcev neuropilina 1 za preprečevanje vezave virusa SARS-CoV-2. Za uporabo tandemskega pristopa farmakofornega modeliranja in virtualnega rešetanja smo uporabili znano kristalno strukturo neuropilina 1 v kompleksu z zaviralcem EG01377 ter uveljavljene aktivne spojine iz znanstvene literature z določeno stopnjo zaviranja vezave različnih ligandov na neuropilin 1, s čimer smo pridobili dva različna farmakoforna modela. Z uporabo teh modelov pri virtualnem rešetanju smo uspešno identificirali 20 spojin zadetkov kot potencialnih zaviralcev neuropilina 1, ki bi jih bilo potrebno eksperimentalno preveriti za potrditev njihove vezavne afinitete in aktivnosti. Identificirane spojine smo primerjali z že znanimi aktivnimi spojinami za boljši vpogled v njihove strukturne podobnosti in z njimi povezane interakcije ligand-neuropilin 1.
Ključne besede:Neuropilin 1, SARS-CoV-2, zaviralci, farmakoforno modeliranje, virtualno rešetanje
Kraj izida:Maribor
Kraj izvedbe:Maribor
Založnik:[Z. Serianz]
Leto izida:2023
Št. strani:1 spletni vir (1 datoteka PDF (X, 58 f.))
PID:20.500.12556/DKUM-86184 Novo okno
UDK:577(043.2)
COBISS.SI-ID:185513219 Novo okno
Datum objave v DKUM:24.11.2023
Število ogledov:537
Število prenosov:62
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
Področja:KTFMB - FKKT
:
SERIANZ, Zala, 2023, Iskanje novih zaviralcev, ki preprečujejo vezavo SARS-CoV-2 na neuropilin 1 : magistrsko delo [na spletu]. Magistrsko delo. Maribor : Z. Serianz. [Dostopano 20 januar 2025]. Pridobljeno s: https://dk.um.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&id=86184
Kopiraj citat
  
Skupna ocena:
0.5
1
1.5
2
2.5
3
3.5
4
4.5
5
(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
Objavi na:Bookmark and Share


Iščem podobna dela...Prosim, počakajte...
Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Licence

Licenca:CC BY-NC-ND 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva-Nekomercialno-Brez predelav 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.sl
Opis:Najbolj omejujoča licenca Creative Commons. Uporabniki lahko prenesejo in delijo delo v nekomercialne namene in ga ne smejo uporabiti za nobene druge namene.
Začetek licenciranja:19.10.2023

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Search for new inhibitors that prevent SARS-CoV-2 binding to neuropilin 1
Opis:Neuropilin 1 is one of the most important co-receptors of vascular endothelial growth factor. It is involved in many physiological and pathological processes, including SARS-CoV-2 binding. Due to the urgent need for innovative strategies against SARS-CoV-2, the master thesis focuses on a computational pathway for the discovery of potential neuropilin 1 inhibitors to prevent the binding of SARS-CoV-2 virus. To apply a tandem approach of pharmacophore modelling and virtual screening, we used the known crystal structure of neuropilin 1 in complex with inhibitor EG01377 as well as known active compounds from the scientific literature with a certain degree of inhibition of different ligands binding to neuropilin 1, to obtain two distinct pharmacophore models. Applying these models in the virtual screening, we successfully identified 20 hit compounds as potential inhibitors of neuropilin 1 that should be experimentally tested to confirm their binding affinity and activity. Identified compounds were further compared with already known active compounds to gain additional insight into their structural similarities and associated ligand-NRP1 interactions.
Ključne besede:Neuropilin 1, SARS-CoV-2, inhibitors, pharmacophore modeling, virtual screening


Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj
Logotipi partnerjev Univerza v Mariboru Univerza v Ljubljani Univerza na Primorskem Univerza v Novi Gorici