| Naslov: | Interakcije biotehnološko relevantnih encimov : magistrsko delo |
|---|
| Avtorji: | ID Grabrovec, Barbara (Avtor)
ID Bren, Urban (Mentor) Več o mentorju... 
ID Leitgeb, Maja (Komentor)
ID Konc, Janez (Komentor) |
|---|
| Datoteke: |  MAG_Grabrovec_Barbara_2019.pdf (2,83 MB)
MD5: B4B499CFCDE376D225054A290342C8F9
PID: 20.500.12556/dkum/bab5fb3b-b08a-4f6b-901e-11d6a1e49437
|
|---|
| Jezik: | Slovenski jezik |
|---|
| Vrsta gradiva: | Magistrsko delo/naloga |
|---|
| Tipologija: | 2.09 - Magistrsko delo |
|---|
| Organizacija: | FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
|
|---|
| Opis: | Encimi so protein, ki pospešujejo biokemijske in kemijske reakcije. Njihove interakcije z ligandi so ključnega pomena za številne biokemične interakcije, ki uravnavajo življenje. Uporabljajo se v biotehnologiji, pri analitskih procesih, v človeški in živalski terapiji (za zdravila) ter v različnih industrijskih procesih, kamor spadajo tekstilna industrija, usnjarska industrija, farmacija, živilska industrija in druge. Kljub vsem dobrim lastnostim encimov, njihovo široko industrijsko uporabo pogosto ovirajo kratkotrajna stabilnost, rok uporabe ter njihova nepopolna regeneracija in ponovna uporaba. Te pomanjkljivosti lahko na splošno odpravimo z imobilizacijo encimov. V zadnjih letih so se pojavile podatkovne baze, ki vsebujejo podatke o interakcijah protein-ligand, kar je pripomoglo k razumevanju funkcij novo odkritih proteinov. Razvile so se številne nove računalniške metode, ki lahko uporabijo informacije shranjenih interakcij, da napovedo nove neznane interakcije. Najpogosteje uporabljena metoda za modeliranje interakcij je metoda molekulskega sidranja, ki se uporablja za simuliranje interakcije med majhno molekulo in proteinom na atomski ravni in nam opiše obnašanje majhne molekule v vezavnem mestu encima.
V magistrskem delu smo s pomočjo programa molekulskega sidranja na encime vezali nizkomolekularne ligande. Strukture encimov smo pridobili v spletni bazi PDB, datoteke ligandov pa v spletni podatkovni bazi ZINC15. Kot rezultat smo dobili strukture ligandov, ki so se najmočneje vezali in njihovo energijo vezave. Rezultate smo pregledali s programoma Excel in Pymol, kjer smo videli 3D slike ligandov, ki so se na naše encime vezali z najnižjo energijo. |
|---|
| Ključne besede: | encim, ligand, imobilizacija, biotehnologija, molekularno modeliranje, molekulsko sidranje |
|---|
| Kraj izida: | Maribor |
|---|
| Kraj izvedbe: | Maribor |
|---|
| Založnik: | [B. Grabrovec] |
|---|
| Leto izida: | 2019 |
|---|
| Št. strani: | VIII, 42 str. |
|---|
| PID: | 20.500.12556/DKUM-75155 |
|---|
| UDK: | 577.15:544.139(043.2) |
|---|
| COBISS.SI-ID: | 22689046 |
|---|
| NUK URN: | URN:SI:UM:DK:XRSGSIG1 |
|---|
| Datum objave v DKUM: | 18.10.2019 |
|---|
| Število ogledov: | 1589 |
|---|
| Število prenosov: | 118 |
|---|
| Metapodatki: |    |
|---|
| Področja: | KTFMB - FKKT
|
|---|
|
:
|
GRABROVEC, Barbara, 2019, Interakcije biotehnološko relevantnih encimov : magistrsko delo [na spletu]. Magistrsko delo. Maribor : B. Grabrovec. [Dostopano 22 april 2025]. Pridobljeno s: https://dk.um.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&id=75155
|
|---|
| | | | Skupna ocena: | (0 glasov) |
|---|
| Vaša ocena: | Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom. |
|---|
| Objavi na: |  |
|---|
Iščem podobna dela... 
Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše
podrobnosti ali sproži prenos. |
