| Naslov: | COVID.si - Skupnostna znanost za boj proti korona virusu |
|---|
| Avtorji: | ID Podlipnik, Črtomir, Univerza v Ljubljani (Avtor)
ID Jukič, Marko (Avtor)
ID Nikitina, Natalia, Institute of Applied Mathematical Research, Karelian Research Center of the Russian Academy of Sciences in Petrozavodsk, Russia (Avtor)
ID Pleško, Sebastian, Univerza v Ljubljani (Avtor)
ID Gilardoni, Lorenzo, University of Milan, Italy (Avtor)
ID Tomšič, Gašper, Univerza v Ljubljani (Avtor)
ID Pevec, Žan (Avtor)
ID Laba, Boštjan (Avtor) |
|---|
| Datoteke: |  https://covid.si/en/ligand-viewer/
Opis: Prikazovalnik ligandov - Ligand Viewer
https://covid.si/en/stats/
Opis: Statistika gruče - Docking statistics
https://covid.si/en/quick-start/
Opis: Software Download and Quick Start
To gradivo ima še več datotek. Celoten seznam je na voljo
spodaj. |
|---|
| Jezik: | Slovenski jezik |
|---|
| Vrsta gradiva: | Strokovno delo |
|---|
| Tipologija: | 2.20 - Zaključena znanstvena zbirka raziskovalnih podatkov |
|---|
| Organizacija: | FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
|
|---|
| Opis: | Projekt “SKUPNOSTNA ZNANOST IN BOJ PROTI KORONA VIRUSU” je odprt projekt skupnosti dobromislečih raziskovalcev in prostovoljcev, ki želijo s svojim delom, znanjem in izkušnjami, prispevati kamenček v mozaiku poznavanja novega korona virusa in bolezni COVID-19, ki jo ta virus povzroča. Skupino vodita strokovnjaka dr. Črtomir Podlipnik in dr. Marko Jukić, z dolgoletnimi izkušnjami s področja računalniško podprtega načrtovanja molekul, farmacevtske kemije in kemo/bioinformatike.
S somišljeniki ter prostovoljci so v zelo kratkem času razvili lastno tehnologijo, ki omogoča porazdeljeno računanje molekulskega sidranja. Tehnologija je osnovana na programčku, ki omogoča povezavo uporabnikovega računalnika s strežnikom, ki porazdeli del knjižnice molekul pripravljenih za molekulsko sidranje (trenutno 10 000 000 spojin). Po končanem sidranju (s programom RxDock), programček pošlje izračunane podatke nazaj na zbirno mesto na strežniku. Po analizi sidranih spojin je končni rezultat seznam molekul s potencialno vezavo na terapevtsko tarčo (v našem primeru so to virusni proteini). Nato lahko preverimo ali so te spojine dobavljive in organiziramo biološko testiranje v sodelovanju z ostalimi raziskovalnimi skupinami. Podatke o nedobavljivih spojinah lahko v nasprotnem primeru posredujemo raziskovalnim skupinam za izvedbo sinteze. V optimalnem scenariju bi lahko identificirali spojine zanimive za farmacevtsko industrijo. Rešitev, ki temelji na porazdeljenem računanju je osnovana na odprtokodnih rešitvah. |
|---|
| Ključne besede: | COVID-19, virus CoV SARS-2, ligandi, proteini, virusna biokemija, računalniško podprto načrtovanje molekul, molekulsko sidranje, porazdeljeno računanje |
|---|
| Kraj izida: | [S. l. |
|---|
| Založnik: | s. n. |
|---|
| Leto izida: | 2020 |
|---|
| PID: | 20.500.12556/DKUM-78236  |
|---|
| UDK: | 578.834 |
|---|
| COBISS.SI-ID: | 41984771 |
|---|
| NUK URN: | URN:SI:UM:DK:4NOTQ8QT |
|---|
| Opomba: | Sistemske zahteve: pregledovalnik za svetovni splet |
|---|
| Datum objave v DKUM: | 22.11.2020 |
|---|
| Število ogledov: | 3443 |
|---|
| Število prenosov: | 109 |
|---|
| Metapodatki: |    |
|---|
| Področja: | Ostalo
|
|---|
|
:
|
PODLIPNIK, Črtomir, JUKIČ, Marko, NIKITINA, Natalia, PLEŠKO, Sebastian, GILARDONI, Lorenzo, TOMŠIČ, Gašper, PEVEC, Žan in LABA, Boštjan, 2020, COVID.si - Skupnostna znanost za boj proti korona virusu [na spletu]. Zaključena znanstvena zbirka raziskovalnih podatkov. 2020. S. l. : s. n. [Dostopano 7 april 2025]. Pridobljeno s: https://covid.si/navodila/
|
|---|
| | | | Skupna ocena: | (0 glasov) |
|---|
| Vaša ocena: | Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom. |
|---|
| Objavi na: |  |
|---|
Iščem podobna dela... 
Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše
podrobnosti ali sproži prenos. |
