Statistika DKUM

Bibliografija osebe. Seznam zajema vsa gradiva in ne le tista, kje je oseba mentor.

Doktorska dela (3)

1. Anja Petek: Vpliv ß-ciklodekstrina na kinetiko in mehanizem reakcije umiljenja etilacetata
2. Veronika Furlan: Preučevanje mehanizmov antikarcinogenega in nevroprotektivnega delovanja naravnih polifenolnih spojin
3. Martin Rozman: Uporaba inverzne geometrijske konfiguracije za razvoj senzorskih in elektrokromnih trakov

Magistrska dela (15)

1. Katja Gole: Primerjava proteomov glavnih predstavnikov virusov iz družine Filoviridae in identifikacija potencialnih vezavnih mest za načrtovanje ligandov
2. Miha Fermišek: Vpliv kovin na protibakterijsko učinkovitost taninov
3. Zala Serianz: Iskanje novih zaviralcev, ki preprečujejo vezavo SARS-CoV-2 na neuropilin 1
4. Tjaša Skarlovnik: Meritve osmolarnosti izotoničnih napitkov za hidracijo telesa pri športni aktivnosti
5. Žan Smrekar: Študij vezave peptidov na Fc regije protiteles
6. Franjo Frešer: Koordinacijske spojine elagitaninov z železovimi(II) ioni: vpliv strukture in pH
7. Tamara Hribernik: Znotrajcelični antioksidativni potencial različnih sort hmelja
8. Matic Orel: Vibracijski in rotacijski prehodi enostavnih molekul
9. Katja Lečnik: Antigenotoksični potencial rožmarinskih ekstraktov
10. Alain Kerhe: Priprava tankoslojnih plasti na osnovi tio 2 v namene protikorozijske zaščite
11. Ajda Sušnik: Adhezija modelnih celic na kovinske elektrode za uporabo v biosenzoriki
12. Zala Štukovnik: Izdelava in optimizacija elektrokemijske celice za uporabo v biosenzoriki
13. Matic Broz: Vpliv polimorfizma posameznega nukleotida rs 4880 na genu sod2 na sekundarno strukturo encima manganove superoksid-dismutaze
14. Barbara Grabrovec: Interakcije biotehnološko relevantnih encimov
15. Mirna Pivac: Funkcionalizacija polietilenskih folij s biopolimeri za razvoj aktivne embalaže

Diplomska dela (36)

1. Alja Špec: Študija in optimizacija vezave antikalinov na male molekule
2. Lamija Ahmetović: Računalniško modeliranje antikarcinogenih učinkov naringenina
3. Tadeja Rožman: Priprava antikorozijske prevleke z enkapsuliranim inhibitorjem
4. Aljaž Knez: Analiza gruč kemijskega prostora protibakterijskih učinkovin
5. Benjamin Stradar: Načrtovanje pentapeptidov za vezavo na fc regijo protiteles
6. Marijana Krstić: Optical detection of stress parameters
7. Stela Tashkova: Optimization of conditions for enzymatic decomposition of fibrous cotton textile waste
8. Jan Čokolič: Eksperimentalna analiza vezave pomožnih snovi na zdravilno učinkovino
9. Eva Patik: Komercialna kurkuma kot inhibitor korozijskih procesov
10. Alen Kostevc: Adsorpcija poliakrilne kisline (PAA) na površino kalcijevega karbonata
11. Ajda Raj Miloševič: Tvorba koordinacijskih spojin galne kisline z bakrovimi in aluminijevimi ioni
12. Deniz Agačević: Študij deskriptorjev molekulske oblike protibakterijskih učinkovin
13. Simon Zadravec: Vpliv velikosti delcev kalcijevega karbonata na lastnosti papirja za inkjet
14. Matej Keber: Izolacija naravne spojine iz hmelja in določitev vrednosti pKa
15. David Tian Hren: Eksperimentalna raziskava rumenenja PVC
16. Tine Vidmar: Protibakterijske učinkovine hmelja
17. Urška Sušec: Identifikacija prevladujočih skeletov v protibakterijskih učinkovinah
18. Tina Dšuban: Med kot inhibitor korozijskih procesov
19. Ana Goričan: Ekstrakt šipka kot zeleni inhibitor korozijskih procesov
20. Jan Gimpelj: Identifikacija prevladujočih funkcionalnih skupin v protibakterijskih učinkovinah
21. Miha Fermišek: Tvorba koordinacijskih spojin med hidrolizirajočimi tanini in Fe(II)
22. Urška Vtič: Pinocembrin iz medu kot potencialni lovilec kemijskih karcinogenov - računalniški pristop
23. Ana Perpar: Tanin kot zaviralec korozije na jeklu
24. Nikolina Cetin: Optimizacija elektrokromnega traku z različnimi vrstami kovinskih oksidov
25. Anja Copot: Pametne prevleke za zaščito konstrukcijskih materialov
26. Staša Velcl: Analiza kemijskega prostora, ki ga zavzemajo protibakterijske učinkovine
27. Klara Laura Konda: Kofein kot inhibitor korozijskih procesov v agresivnem mediju
28. Ines Masten: Detekcija ohranjenih vod na medproteinskih površinah
29. Matic Košir: Primerjava bioprocesov s celično linijo CHO v različnih bioreaktorjih
30. Franjo Frešer: Tvorba koordinacijskih spojin med osnovnimi gradniki taninov in Fe(II)
31. Simona Sedonja: Inhibicijska učinkovitost propolisa v namen zaščite konstrukcijskih materialov
32. Žan Smrekar: Računalniško načrtovanje terapevtskih proteinov
33. Špela Slapničar: Inhibicijska učinkovitost mešanice škroba in površinsko aktivnih snovi v kislem mediju
34. Rok Špendl: Inhibicijske lastnosti medu na jeklu v agresivnem mediju
35. Tibor Mlakar: Primerjava izračunanih in numeričnih rezultatov pri obravnavi molekule vodika
36. Vanja Mlinarič: Vpliv ionov Hofmeisterjeve vrste na premik kritične micelne koncentracije površinsko aktivnih snovi (ionskega tipa)

Druga dela (32)

1. Veronika Furlan, Jelena Tošović, Urban Bren: QM-CSA: a novel quantum mechanics-based protocol for evaluation of the carcinogen-scavenging activity of polyphenolic compounds
2. Anja Petek, Urban Bren, Gregor Hostnik: How deprotonation of cohumulone and colupulone influence their UV/Vis and CD spectrum
3. Steliana Tsouri, Evanthia Tselo, Georgios E. Premetis, Veronika Furlan, Panagiota D. Pantiora, Barbara Mavroidi, Dimitris Matiadis, Maria Pelecanou, Anastassios C. Papageorgiou, Urban Bren, Marina Sagnou, Nikolaos E. Labrou: A monocarbonyl curcuminoid derivative inhibits the activity of human glutathione transferase A4-4 and chemosensitizes glioblastoma cells to temozolomide
4. Franjo Frešer, Urban Bren, Gregor Hostnik: Chelation of iron(II) ions by ellagitannins - effects of hexahydroxydiphenoyl and nonahydroxytriphenoyl groups
5. Ahmed Sabt, Veronika Furlan, Urban Bren: Novel coumarin-6-sulfonamide-chalcone hybrids as glutathione transferase P1-1 inhibitors
6. Valeriia V. Sliesarenko, Urban Bren, Aleksandra Lobnik: Fluorescence based dopamine detection
7. Sebastjan Kralj, Marko Jukič, Urban Bren: Molecular Filters in Medicinal Chemistry
8. Zala Kolenc, Tomaž Langerholc, Gregor Hostnik, Miha Ocvirk, Sara Štumpf, Maša Pintarič, Iztok Jože Košir, Andreja Čerenak, Alenka Garmut, Urban Bren: Antimicrobial properties of different hop (Humulus lupulus) genotypes
9. Vid Ravnik, Marko Jukič, Urban Bren: Identifying Metal Binding Sites in Proteins Using Homologous Structures, the MADE Approach
10. Samo Lešnik, Marko Jukič, Urban Bren: Mechanistic insights of polyphenolic compounds from rosemary bound to their protein targets obtained by molecular dynamics simulations and free-energy calculations
11. Matic Broz, Chris Oostenbrink, Urban Bren: The effect of microwaves on protein structure: molecular dynamics approach
12. Jelena Tošović, Domagoj Fijan, Marko Jukič, Urban Bren: Conserved water networks identification for drug design using density clustering approaches on positional and orientational data
13. Zala Kolenc, Tamara Hribernik, Tomaž Langerholc, Maša Pintarič, Maja Prevolnik Povše, Urban Bren: Antioxidant activity of different hop (Humulus lupulus L.) genotypes
14. Veronika Furlan, Urban Bren: Helichrysum italicum
15. Panagiota D. Pantiora, Veronika Furlan, Dimitris Matiadis, Barbara Mavroidi, Fereniki Perperopoulou, Anastassios C. Papageorgiou, Marina Sagnou, Urban Bren, Maria Pelecanou, Nikolaos E. Labrou: Monocarbonyl Curcumin Analogues as Potent Inhibitors against Human Glutathione Transferase P1-1
16. Sara Štumpf, Gregor Hostnik, Tomaž Langerholc, Maša Pintarič, Zala Kolenc, Urban Bren: The Influence of Chestnut Extract and Its Components on Antibacterial Activity against Staphylococcus aureus
17. Zala Štukovnik, Regina Fuchs-Godec, Urban Bren: Nanomaterials and their recent applications in impedimetric biosensing
18. Sebastjan Kralj, Marko Jukič, Miha Bahun, Luka Krajnc, Anja Kolarič, Milan Hodošček, Nataša Poklar Ulrih, Urban Bren: Identification of triazolopyrimidinyl scaffold SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) inhibitor
19. Marko Jukič, Sebastjan Kralj, Anja Kolarič, Urban Bren: Design of Tetra-Peptide Ligands of Antibody Fc Regions Using In Silico Combinatorial Library Screening
20. Matic Broz, Marko Jukič, Urban Bren: Naive prediction of protein backbone phi and psi dihedral angles using deep learning
21. Matic Broz, Anja Kolarič, Marko Jukič, Urban Bren: Neuropilin (NRPs) related pathological conditions and their modulators
22. Matic Broz, Veronika Furlan, Samo Lešnik, Marko Jukič, Urban Bren: The effect of the Ala16Val mutation on the secondary structure of the manganese superoxide dismutase mitochondrial targeting sequence
23. Sebastjan Kralj, Marko Jukič, Urban Bren: Comparative Analyses of Medicinal Chemistry and Cheminformatics Filters with Accessible Implementation in Konstanz Information Miner (KNIME)
24. Marko Jukič, Dušanka Janežič, Urban Bren: Ensemble Docking Coupled to Linear Interaction Energy Calculations for Identification of Coronavirus Main Protease (3CLpro) Non-Covalent Small-Molecule Inhibitors
25. Urban Bren: Zbirka rešenih nalog iz Fizikalne kemije I
26. Lidija Fras Zemljič, Damjan Tomažin, Urban Bren, Maša Knez Marevci, Larisa Spasković, Uroš Filipič, Katja Kuzmič, Klavdija Petelin, Martina Švajger, Rok Špindler, Stanko Kramer, Katja Lečnik: Razvoj aktivne plastične embalaže
27. Regina Fuchs-Godec, Urban Bren: Pojavi na površinah
28. Regina Fuchs-Godec, Urban Bren: Laboratory manual for thermodynamics
29. Tomaž Mohorič, Urban Bren, Vojko Vlachy: Effects of translational and rotational degrees of freedom on the hydration of ionic solutes as seen by the popular water models
30. Nataša Logar Berginc, Katja Benevol Gabrijelčič, Urban Bren, Sašo Dolenc, Katarina Krapež, Miro Romih, Mojca Žagar Karer, Simon Krek, Vojko Gorjanc, Mateja Jemec Tomazin, Špela Arhar Holdt, Darja Fišer: Terminologija v poklicnem vsakdanu
31. Mitja Ogrizek, Janez Konc, Urban Bren, Milan Hodošček, Dušanka Janežič: Role of magnesium ions in the reaction mechanism at the interface between Tm1631 protein and its DNA ligand
32. Eva Brglez Mojzer, Maša Knez Marevci, Mojca Škerget, Željko Knez, Urban Bren: Polyphenols: extraction methods, antioxidative action, bioavailability and anticarcinogenic effects