| | SLO | ENG | Piškotki in zasebnost

Večja pisava | Manjša pisava

Izpis gradiva Pomoč

Naslov:Design of Tetra-Peptide Ligands of Antibody Fc Regions Using In Silico Combinatorial Library Screening
Avtorji:ID Jukič, Marko (Avtor)
ID Kralj, Sebastjan (Avtor)
ID Kolarič, Anja (Avtor)
ID Bren, Urban (Avtor)
Datoteke:.pdf pharmaceuticals-16-01170-v2.pdf (8,11 MB)
MD5: F51D48DFFD3197B28111512BB201604F
 
URL https://www.mdpi.com/1424-8247/16/8/1170
 
Jezik:Angleški jezik
Vrsta gradiva:Članek v reviji
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
Opis:Abstract Peptides, or short chains of amino-acid residues, are becoming increasingly important as active ingredients of drugs and as crucial probes and/or tools in medical, biotechnological, and pharmaceutical research. Situated at the interface between small molecules and larger macromolecular systems, they pose a difficult challenge for computational methods. We report an in silico peptide library generation and prioritization workflow using CmDock for identifying tetrapeptide ligands that bind to Fc regions of antibodies that is analogous to known in vitro recombinant peptide libraries’ display and expression systems. The results of our in silico study are in accordance with existing scientific literature on in vitro peptides that bind to antibody Fc regions. In addition, we postulate an evolving in silico library design workflow that will help circumvent the combinatorial problem of in vitro comprehensive peptide libraries by focusing on peptide subunits that exhibit favorable interaction profiles in initial in silico peptide generation and testing.
Ključne besede:peptide design, in silico combinatorial library, peptide combinatorial library, peptide library design, high-throughput virtual screening, peptide molecular docking, antibody purification, peptide drug design, recombinant peptide libraries
Status publikacije:Objavljeno
Verzija publikacije:Objavljena publikacija
Datum objave:01.01.2023
Založnik:MDPI
Leto izida:2023
Št. strani:22 str.
Številčenje:Vol. 16, no. 8, [Article no.] 1170
PID:20.500.12556/DKUM-86440 Novo okno
UDK:577
COBISS.SI-ID:161574147 Novo okno
DOI:10.3390/ph16081170 Novo okno
ISSN pri članku:1424-8247
Datum objave v DKUM:01.12.2023
Število ogledov:189
Število prenosov:11
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
Področja:Ostalo
:
Kopiraj citat
  
Skupna ocena:(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
Objavi na:Bookmark and Share


Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Gradivo je del revije

Naslov:Pharmaceuticals
Skrajšan naslov:Pharmaceuticals
Založnik:MDPI, Molecular Diversity Preservation International
ISSN:1424-8247
COBISS.SI-ID:517582617 Novo okno

Gradivo je financirano iz projekta

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:I0-E015-2022
Naslov:Sofinanciranje izvajanja mednarodnega infrastrukturnega projekta BBMRI

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J1-2471-2020
Naslov:Kemijska karcinogeneza: Mehanistični vpogled

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P2-0046-2019
Naslov:Separacijski procesi in produktna tehnika

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P1-0403-2019
Naslov:Računsko intenzivni kompleksni sistemi

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J1-4398-2022
Naslov:Kemijska karcinogeneza in nevrodegeneracija: Molekularni mehanizem vpliva mikrovalovnega sevanja

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:L2-3175-2021
Naslov:Napredna ekstrakcija in formulacija funkcionalnih taninskih prahranskih dopolnil z blagodejnimi zdravstvenimi učinki

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:L2-4430-2022
Naslov:Proizvodnja, izolacija in formulacija zdravju koristnih substanc iz Helichrysum Italicum za uporabo v kozmetični industriji

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J7-4638-2022
Naslov:Načrtovanje selektivnih katalitskih postopkov pretvorbe CO2 v etanol – UliSess

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J3-4498-2022
Naslov:Multi-omska raziskava signalne poti NFkB pri multipli sklerozi

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J1-4414-2022
Naslov:ProBiS-Fold pristop za določanje vezavnih mest za celoten strukturni človeški proteom pri odkrivanju zdravil

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J3-4497-2022
Naslov:Neinvazivni multi-omski biooznačevalci v podtipih imunskih celic za personalizirano zdravljenje otroške astme in molekularni mehanizmi neodzivnosti na inhalacijske kortikosteroide

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J4-4633-2023
Naslov:Razumevanje mehanizmov in preprečevanje agregacije biofarmacevtskih proteinov

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P2-0438-2022
Naslov:Optični kemijski/bio senzorski sistemi (OPTISENS)

Licence

Licenca:CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:peptidi, amino kisline


Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj
Logotipi partnerjev Univerza v Mariboru Univerza v Ljubljani Univerza na Primorskem Univerza v Novi Gorici