| Naslov: | Načrtovanje pentapeptidov za vezavo na fc regijo protiteles : diplomsko delo visokošolskega strokovnega študijskega programa I. stopnje |
|---|
| Avtorji: | ID Stradar, Benjamin (Avtor)
ID Jukič, Marko (Mentor) Več o mentorju... 
ID Bren, Urban (Komentor) |
|---|
| Datoteke: |  VS_Stradar_Benjamin_2023.pdf (6,20 MB)
MD5: 3DC60B0F0232C63502B2E12BF93608C1
|
|---|
| Jezik: | Slovenski jezik |
|---|
| Vrsta gradiva: | Diplomsko delo/naloga |
|---|
| Tipologija: | 2.11 - Diplomsko delo |
|---|
| Organizacija: | FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
|
|---|
| Opis: | Razvoj novih peptidnih zdravilnih učinkovin je zelo zahtevna naloga kemijske in farmacevtske industrije. Delo lahko olajša uporaba računalniških pristopov in simulacij. Z njimi lahko uspešno modeliramo interakcije, ki so ključne pri razumevanju delovanja in razvoja novih zdravilnih učinkovin. Peptidi zajemajo prednosti majhnih molekul ter tarčno specifičnost večjih struktur, kot so proteini. V diplomski nalogi smo za načrtovanje novih potencialnih struktur peptidov uporabili računalniške in bioinformacijske pristope kot sta mulekulsko sidranje in kemoinformacijska analiza. Za načrtovanje peptidov smo se osredotočili predvsem na tarčo Fc regije protiteles, kjer smo ustrezno strukturo pridobili na prosto dostopnem spletnem mestu https://www.rcsb.org/ (PDB ID: 5U52). Načrtovali in identificirali smo potencialne pentapeptide z uporabo struktur iz predhodno načrtovane knjižnice tetrapeptidov. Za pripravo knjižice struktur pentapeptidov in analizo rezultatov pa smo uporabili 100 najboljših predhodno identificiranih tetrapeptidov. Nato smo izvedli molekulsko sidranje in uporabili programsko opremo CmDock. Podatke smo nato analizirali z uporabo programov PyMOL in PLIP. Uporabljen protokol je v primerjavi z uporabo kombinatoričnih knjižnic omogočil učinkovitejše |
|---|
| Ključne besede: | pentapeptidi, Fc regija, molekulsko sidranje, PyMol, CmDock, peptidno sidranje |
|---|
| Kraj izida: | Maribor |
|---|
| Kraj izvedbe: | Maribor |
|---|
| Založnik: | [B. Stradar] |
|---|
| Leto izida: | 2023 |
|---|
| Št. strani: | 1 spletni vir (1 datoteka PDF (IX, 40 f.)) |
|---|
| PID: | 20.500.12556/DKUM-85806 |
|---|
| UDK: | 543.645.6:[604.4:615.331](043.2) |
|---|
| COBISS.SI-ID: | 171018243 |
|---|
| Datum objave v DKUM: | 25.09.2023 |
|---|
| Število ogledov: | 469 |
|---|
| Število prenosov: | 46 |
|---|
| Metapodatki: |    |
|---|
| Področja: | KTFMB - FKKT
|
|---|
|
:
|
Kopiraj citat |
|---|
| | | | Skupna ocena: | (0 glasov) |
|---|
| Vaša ocena: | Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom. |
|---|
| Objavi na: |  |
|---|
Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše
podrobnosti ali sproži prenos. |
