| | SLO | ENG | Piškotki in zasebnost

Večja pisava | Manjša pisava

Izpis gradiva Pomoč

Naslov:Comparative Analyses of Medicinal Chemistry and Cheminformatics Filters with Accessible Implementation in Konstanz Information Miner (KNIME)
Avtorji:ID Kralj, Sebastjan (Avtor)
ID Jukič, Marko (Avtor)
ID Bren, Urban (Avtor)
Datoteke:.pdf RAZ_Kralj_Sebastjan_2022.pdf (4,19 MB)
MD5: 8ECA951BCA28AC3E4108F634E7A70477
 
URL https://www.mdpi.com/1422-0067/23/10/5727
 
Jezik:Angleški jezik
Vrsta gradiva:Znanstveno delo
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
Opis:High-throughput virtual screening (HTVS) is, in conjunction with rapid advances in computer hardware, becoming a staple in drug design research campaigns and cheminformatics. In this context, virtual compound library design becomes crucial as it generally constitutes the first step where quality filtered databases are essential for the efficient downstream research. Therefore, multiple filters for compound library design were devised and reported in the scientific literature. We collected the most common filters in medicinal chemistry (PAINS, REOS, Aggregators, van de Waterbeemd, Oprea, Fichert, Ghose, Mozzicconacci, Muegge, Egan, Murcko, Veber, Ro3, Ro4, and Ro5) to facilitate their open access use and compared them. Then, we implemented these filters in the open platform Konstanz Information Miner (KNIME) as a freely accessible and simple workflow compatible with small or large compound databases for the benefit of the readers and for the help in the early drug design steps.
Ključne besede:high-throughput virtual screening, virtual screening, compound libraries, library design, compound filtering
Status publikacije:Objavljeno
Verzija publikacije:Objavljena publikacija
Datum objave:01.01.2022
Leto izida:2022
Št. strani:15 str.
Številčenje:Vol. 23, no. 10
PID:20.500.12556/DKUM-84799 Novo okno
UDK:577
COBISS.SI-ID:108738563 Novo okno
DOI:10.3390/ijms23105727 Novo okno
ISSN pri članku:1422-0067
Datum objave v DKUM:25.07.2023
Število ogledov:390
Število prenosov:29
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
Področja:Ostalo
:
Kopiraj citat
  
Skupna ocena:(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
Objavi na:Bookmark and Share


Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Gradivo je del revije

Naslov:International journal of molecular sciences
Skrajšan naslov:Int. j. mol. sci.
Založnik:MDPI
ISSN:1422-0067
COBISS.SI-ID:2779162 Novo okno

Gradivo je financirano iz projekta

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P2-0046
Naslov:Separacijski procesi in produktna tehnika

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P1-0403
Naslov:Računsko intenzivni kompleksni sistemi

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:L2-3175
Naslov:Napredna ekstrakcija in formulacija funkcionalnih taninskih prahranskih dopolnil z blagodejnimi zdravstvenimi učinki

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J1-1715
Naslov:Atlas proteinskih interakcij za napovedovanje genskih variacij povezanih z interakcijami z zdravili in razvojem bolezni

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J1-2471
Naslov:Kemijska karcinogeneza: Mehanistični vpogled

Financer:Drugi - Drug financer ali več financerjev
Program financ.:ELIXIR-SI

Financer:Drugi - Drug financer ali več financerjev
Program financ.:HPC RIVR

Licence

Licenca:CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:kemija v medicini, podatkovne baze


Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj
Logotipi partnerjev Univerza v Mariboru Univerza v Ljubljani Univerza na Primorskem Univerza v Novi Gorici