| | SLO | ENG | Piškotki in zasebnost

Večja pisava | Manjša pisava

Izpis gradiva Pomoč

Naslov:Študij vezave peptidov na Fc regije protiteles : magistrsko delo
Avtorji:ID Smrekar, Žan (Avtor)
ID Bren, Urban (Mentor) Več o mentorju... Novo okno
ID Jukič, Marko (Komentor)
Datoteke:.pdf MAG_Smrekar_Zan_2023.pdf (2,74 MB)
MD5: 183D531E5247D711179FE996D47D33FE
 
Jezik:Slovenski jezik
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga
Tipologija:2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
Opis:Z uporabo računalniških pristopov in simulacij lahko uspešno modeliramo interakcije, ki so ključne pri razumevanju delovanja in razvoju novih zdravilnih učinkovin. Tekom razvoja se pojavljajo novi razredi peptidnih zdravil. Peptidi so sestavljeni iz verig aminokislinskih preostankov in zajemajo prednosti tako majhnih molekul kot tudi tarčno specifičnost večjih struktur, kot so proteini. Za načrtovanje novih potencialnih struktur peptidov smo tako uporabili računalniške in bioinformacijske pristope, kot je molekulsko sidranje. V magistrski nalogi smo se osredotočili na Fc regijo protiteles kot receptor. Načrtovali in identificirali smo potencialne tetrapeptide s strukturo, ki je podobna eksperimentalnim podatkom. Problema smo se lotili s pomočjo računalniških programov. Ustrezni receptor smo pridobili na prosto dostopnem spletnem mestu https://www.rcsb.org/ (PDB ID: 5U52), za pripravo knjižnice struktur tetrapeptidov in analizo rezultatov smo uporabili analitično platformo KNIME, za molekulsko sidranje smo uporabili programsko opremo CmDock in za grafični vpogled ciljnih struktur računalniški program PyMol.
Ključne besede:peptidi, Fc regija, molekulsko sidranje, KNIME Analytics Platform, PyMol, peptidno sidranje
Kraj izida:Maribor
Kraj izvedbe:Maribor
Založnik:[Ž. Smrekar]
Leto izida:2023
Št. strani:1 spletni vir (1 datoteka PDF (IX, 54 f.))
PID:20.500.12556/DKUM-84049 Novo okno
UDK:577.112.5.016(043.2)
COBISS.SI-ID:157286915 Novo okno
Datum objave v DKUM:25.05.2023
Število ogledov:580
Število prenosov:78
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
Področja:KTFMB - FKKT
:
Kopiraj citat
  
Skupna ocena:(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
Objavi na:Bookmark and Share


Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Licence

Licenca:CC BY-NC-ND 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva-Nekomercialno-Brez predelav 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.sl
Opis:Najbolj omejujoča licenca Creative Commons. Uporabniki lahko prenesejo in delijo delo v nekomercialne namene in ga ne smejo uporabiti za nobene druge namene.
Začetek licenciranja:03.04.2023

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Study of peptide binding to antibody Fc region
Opis:Computer simulations enable us to examine complex interactions, which are crucial for understanding the mechanisms and the developtment of new active drugs. Lately, new peptide classes of drugs have been emerging. Peptides are composed of chains of amino-acid residues and capture the advantages of both small molecules as well as the target specificity of larger structures such as proteins. Computational and bioinformatics approaches were used to design new potential peptides, where we focused on Fc region of antibodies as the receptor. We designed and identified tetrapeptides with structures analogous to experimental studies. The corresponding receptor was obtained via https://www.rcsb.org database, the KNIME analytical platform was used to prepare the library of tetrapeptide structures and analyse the final results, the CmDock software was applied for molecular docking and the PyMol software for graphical analysis.
Ključne besede:peptides, Fc region, molecular docking, KNIME Analytics Platform, PyMol, peptide docking


Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj
Logotipi partnerjev Univerza v Mariboru Univerza v Ljubljani Univerza na Primorskem Univerza v Novi Gorici