| | SLO | ENG | Piškotki in zasebnost

Večja pisava | Manjša pisava

Izpis gradiva Pomoč

Naslov:COVID.si - Skupnostna znanost za boj proti korona virusu
Avtorji:ID Podlipnik, Črtomir, Univerza v Ljubljani (Avtor)
ID Jukič, Marko (Avtor)
ID Nikitina, Natalia, Institute of Applied Mathematical Research, Karelian Research Center of the Russian Academy of Sciences in Petrozavodsk, Russia (Avtor)
ID Pleško, Sebastian, Univerza v Ljubljani (Avtor)
ID Gilardoni, Lorenzo, University of Milan, Italy (Avtor)
ID Tomšič, Gašper, Univerza v Ljubljani (Avtor)
ID Pevec, Žan (Avtor)
ID Laba, Boštjan (Avtor)
Datoteke:URL https://covid.si/en/ligand-viewer/
Opis: Prikazovalnik ligandov - Ligand Viewer
 
URL https://covid.si/en/stats/
Opis: Statistika gruče - Docking statistics
 
URL https://covid.si/navodila/
Opis: Programska oprema - Prenos in hitri začetek
 
To gradivo ima še več datotek. Celoten seznam je na voljo spodaj.
Jezik:Slovenski jezik
Vrsta gradiva:Strokovno delo
Tipologija:2.20 - Zaključena znanstvena zbirka raziskovalnih podatkov
Organizacija:FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
Opis:Projekt “SKUPNOSTNA ZNANOST IN BOJ PROTI KORONA VIRUSU” je odprt projekt skupnosti dobromislečih raziskovalcev in prostovoljcev, ki želijo s svojim delom, znanjem in izkušnjami, prispevati kamenček v mozaiku poznavanja novega korona virusa in bolezni COVID-19, ki jo ta virus povzroča. Skupino vodita strokovnjaka dr. Črtomir Podlipnik in dr. Marko Jukić, z dolgoletnimi izkušnjami s področja računalniško podprtega načrtovanja molekul, farmacevtske kemije in kemo/bioinformatike. S somišljeniki ter prostovoljci so v zelo kratkem času razvili lastno tehnologijo, ki omogoča porazdeljeno računanje molekulskega sidranja. Tehnologija je osnovana na programčku, ki omogoča povezavo uporabnikovega računalnika s strežnikom, ki porazdeli del knjižnice molekul pripravljenih za molekulsko sidranje (trenutno 10 000 000 spojin). Po končanem sidranju (s programom RxDock), programček pošlje izračunane podatke nazaj na zbirno mesto na strežniku. Po analizi sidranih spojin je končni rezultat seznam molekul s potencialno vezavo na terapevtsko tarčo (v našem primeru so to virusni proteini). Nato lahko preverimo ali so te spojine dobavljive in organiziramo biološko testiranje v sodelovanju z ostalimi raziskovalnimi skupinami. Podatke o nedobavljivih spojinah lahko v nasprotnem primeru posredujemo raziskovalnim skupinam za izvedbo sinteze. V optimalnem scenariju bi lahko identificirali spojine zanimive za farmacevtsko industrijo. Rešitev, ki temelji na porazdeljenem računanju je osnovana na odprtokodnih rešitvah.
Ključne besede:COVID-19, virus CoV SARS-2, ligandi, proteini, virusna biokemija, računalniško podprto načrtovanje molekul, molekulsko sidranje, porazdeljeno računanje
Kraj izida:[S. l.
Založnik:s. n.
Leto izida:2020
PID:20.500.12556/DKUM-78236 Novo okno
UDK:578.834
COBISS.SI-ID:41984771 Novo okno
NUK URN:URN:SI:UM:DK:4NOTQ8QT
Opomba:Sistemske zahteve: pregledovalnik za svetovni splet
Datum objave v DKUM:22.11.2020
Število ogledov:2898
Število prenosov:85
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
Področja:Ostalo
:
Kopiraj citat
  
Skupna ocena:(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
Objavi na:Bookmark and Share


Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Licence

Licenca:CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.
Začetek licenciranja:22.11.2020

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:COVID.si - Citizen Science and the fight against the coronavirus
Opis:In our project, we are looking for ligands – small molecules that can successfully bind to protein targets and modulate a specific process that is crucial for the virus biochemistry. Together we have developed software that can be easily installed on your computer to help participants help find the cure for today’s invisible enemy. Based on molecular docking, the ideal ligand should be complementary in shape and properties to the binding site of the target biomolecule. Although the complementarity of small molecules is only one prerequisite for the use of a molecule as a drug. The search for the right molecule is best illustrated by finding a small needle in a huge haystack. It is a much more difficult problem because of the number of possible molecular structures. The amount of all possible molecular structures is also called the chemical universe – the size of this abstract space can be estimated to be 10 to the power of 80. There are many galaxies in this chemical universe, and one of the galaxies is a galaxy with potentially pharmacologically active molecules. The method for this purpose is called virtual screening. In principle, the larger the part of the chemical universe that we study, the higher the likelihood of finding a potential cure for the coronavirus.
Ključne besede:COVID-19, virus CoV SARS-2, ligands, proteins, virus biochemistry, molecular docking, computer supporting molecular docking, distributed computing


Datoteke

Podatki se nalagajo...

Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj
Logotipi partnerjev Univerza v Mariboru Univerza v Ljubljani Univerza na Primorskem Univerza v Novi Gorici