| | SLO | ENG | Piškotki in zasebnost

Večja pisava | Manjša pisava

Izpis gradiva

Naslov:Optimizacija zvijanja proteinov znotraj kubične mreže s pomočjo evolucijskega algoritma in grafične procesne enote : diplomsko delo
Avtorji:Vipotnik, Matic (Avtor)
Bošković, Borko (Mentor) Več o mentorju... Novo okno
Brest, Janez (Komentor)
Datoteke:.pdf UN_Vipotnik_Matic_2020.pdf (748,33 KB)
MD5: EAF18D2F2C2BACDC1E62C782074A8AD5
 
Jezik:Slovenski jezik
Vrsta gradiva:Diplomsko delo/naloga (mb11)
Tipologija:2.11 - Diplomsko delo
Organizacija:FERI - Fakulteta za elektrotehniko, računalništvo in informatiko
Opis:V diplomskem delu smo implementirali algoritem za optimizacijo zvijanja proteinov znotraj modela HP. Algoritem na centralno procesni enoti porabi veliko časa, da protein zvije v optimalno strukturo. Zato smo algoritem prilagodili, da se izvaja na grafični procesni enoti. Učinkovitost algoritma smo analizirali na znanih sekvencah iz literature. S pomočjo algoritma, ki se je izvajal na grafični procesni enoti smo v povprečju dosegli 10,2 - kratno pohitritev v primerjavi z algoritmom, ki se izvaja na centralno procesni enoti.
Ključne besede:zvijanje proteinov, CUDA, optimizacija, evolucijski algoritem
Leto izida:2020
Kraj izvedbe:Maribor
Založnik:[M. Vipotnik]
Št. strani:X, 30 f.
Izvor:Maribor
UDK:004.318.021(043.2)
COBISS_ID:35582723 Novo okno
NUK URN:URN:SI:UM:DK:ZSNWYAFN
Število ogledov:170
Število prenosov:45
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
Področja:KTFMB - FERI
:
  
Skupna ocena:(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
Objavi na:AddThis
AddThis uporablja piškotke, za katere potrebujemo vaše privoljenje.
Uredi privoljenje...

Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Licence

Licenca:CC BY-NC-ND 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva-Nekomercialno-Brez predelav 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.sl
Opis:Najbolj omejujoča licenca Creative Commons. Uporabniki lahko prenesejo in delijo delo v nekomercialne namene in ga ne smejo uporabiti za nobene druge namene.
Začetek licenciranja:16.09.2020

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Protein folding optimization within a cubic lattice by using an evolutionary algorithm and a graphics processing unit
Opis:In the thesis, we implemented an algorithm for protein folding optimization within the HP model. The algorithm on the central processing unit takes a long time to fold protein into an optimal structure. Therefore, we adapted the algorithm to run on a graphics processing unit. The efficiency of the algorithm was analyzed on well-known sequences from the literature. With the help of an algorithm that was running on a graphics processing unit, we achieved on average speedup of 10,2 in compared to algorithm running on central processing unit.
Ključne besede:protein folding, CUDA, optimization, evolutionary algorithm


Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj
Logotipi partnerjev Univerza v Mariboru Univerza v Ljubljani Univerza na Primorskem Univerza v Novi Gorici