| Title: | Rekonstrukcija funkcionalnih mrež iz dinamike pankreasnih celic beta |
|---|
| Authors: | ID Murko, Jakob (Author)
ID Marhl, Marko (Mentor) More about this mentor... 
ID Gosak, Marko (Co-mentor)
ID Stožer, Andraž (Co-mentor) |
|---|
| Files: |  MAG_Murko_Jakob_2019.pdf (3,34 MB)
MD5: 39BBB1DEB841961CF0F00F8211AD0D36
PID: 20.500.12556/dkum/b0ffe69e-09d1-41de-9f4b-6431cb41b441
|
|---|
| Language: | Slovenian |
|---|
| Work type: | Master's thesis/paper |
|---|
| Typology: | 2.09 - Master's Thesis |
|---|
| Organization: | FNM - Faculty of Natural Sciences and Mathematics
|
|---|
| Abstract: | V magistrskem delu obravnavamo funkcionalno povezanost celic beta. Te celice se nahajajo v Langerhansovih otočkih v trebušni slinavki in so ključne pri uravnavanju koncentracije glukoze v krvi, saj ob povečani ravni glukoze v organizmu izločajo hormon inzulin. V prvi fazi dela dinamiko električno vzdraženih celic beta simuliramo z modelom, v drugi fazi pa se osredotočimo na analizo eksperimentalno izmerjene dinamike znotrajceličnega kalcija. Za opis dinamike posameznih celic uporabimo fenomenološki model, t.i. iterativno mapo Rulkova. Posamezne Rulkove oscilatorje med seboj povežemo v mrežo, s čimer simuliramo funkcijo presledkovnih stikov, s katerimi so povezane celice beta v realnem tkivu. Da bi naš večcelični model čimbolj približali realnemu obnašanju, vpeljemo tudi naključno in prostorsko definirano heterogenost celic. Na podlagi podatkov aktivnosti celic iz simulacij določimo funkcionalno povezanost le-teh. Predstavimo dve metodi določitve funkcionalne mreže, to je korelacijsko in metodo pseudo-inverza kovariance. Analiza simuliranih podatkov pokaže, da sta obe metodi zanesljivi, zato jih preizkusimo tudi na eksperimentalno pridobljenih podatkih, in sicer na in situ meritvah kalcijeve aktivnosti v svežih tkivnih rezinah mišje trebušne slinavke. Ugotovimo, da sta si funkcionalna mreža na podlagi simulacijskih in eksperimentalnih podatkov podobni, kar nam kaže na natančno obnašanje modela. Z analizo obeh funkcionalnih mrež ustvarjenih na podlagi eksperimentalnih podatkov lahko vsaj delno sklepamo na strukturo povezav presledkovnih stikov v opazovani plasti Langerhansovega otočka. Pomembna je tudi ugotovitev, da v funkcionalni mreži celic beta opazimo celice z nadpovprečnim številom povezav, tudi daljnosežnih, kar je v skladu z ugotovitvami preteklih raziskav. |
|---|
| Keywords: | celice beta, Langerhansov otoček, funkcionalna mreža, Rulkov model, celična heterogenost, korelacijski koeficient, pseudo-inverz kovariance. |
|---|
| Place of publishing: | Maribor |
|---|
| Publisher: | [J. Murko] |
|---|
| Year of publishing: | 2019 |
|---|
| PID: | 20.500.12556/DKUM-74921 |
|---|
| UDC: | 577(043.2) |
|---|
| COBISS.SI-ID: | 24864776 |
|---|
| NUK URN: | URN:SI:UM:DK:AELX1YC4 |
|---|
| Publication date in DKUM: | 05.11.2019 |
|---|
| Views: | 993 |
|---|
| Downloads: | 88 |
|---|
| Metadata: |     |
|---|
| Categories: | FNM
|
|---|
|
:
|
Kopiraj citat |
|---|
| | | | Average score: | (0 votes) |
|---|
| Your score: | Voting is allowed only for logged in users. |
|---|
| Share: |  |
|---|
|
|
Hover the mouse pointer over a document title to show the abstract or click
on the title to get all document metadata. |
