| | SLO | ENG | Piškotki in zasebnost

Večja pisava | Manjša pisava

Izpis gradiva

Naslov:Analiza bioloških poti povezanih z odgovorom na biološko terapijo pri bolnikih z multiplo sklerozo z uporabo orodij genske ontologije : magistrsko delo
Avtorji:Stokić, Suzana (Avtor)
Potočnik, Uroš (Mentor) Več o mentorju... Novo okno
Repnik, Katja (Komentor)
Datoteke:.pdf MAG_Stokic_Suzana_2019.pdf (2,22 MB)
MD5: 89D857106DC0DD980A3385A10C0FB9D4
 
Jezik:Slovenski jezik
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga (mb22)
Tipologija:2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
Opis:Multipla skleroza (MS) je najbolj pogosta kronična avtoimuna bolezen centralnega živčnega sistema. Epidemiološki podatki kažejo, da tako genetski kot tudi okoljski dejavniki prispevajo k tveganju za razvoj MS. Zdravljenje se navadno začne z biološkimi zdravili interferoni beta (INF-beta) in glatiramer acetat (GA). Iz literature je razvidno, da 30-50 % bolnikov ne odgovarja na terapijo prvega reda, na kar vplivajo tudi razlike v genetski variabilnosti med posamezniki. Zato je zelo pomembno identificirati biooznačevalce, s katerimi bi lahko napovedali odziv na terapijo še pred zdravljenjem ter s tem zmanjšali stranske učinke in dosegli maksimalno učinkovitost in varnost v zgodnji fazi bolezni. V tem magistrskem delu smo želeli s pomočjo spletnih podatkovnih zbirk ter z ustreznimi bioinformatskimi orodji in orodji genske ontologije raziskati farmakogenomiko MS, na podlagi pridobljenih podatkov predpostaviti molekularno biološko pot odziva na farmakološko zdravljenje ter poiskati skupne biološke mehanizme, ki napovedujejo najboljši odziv na zdravljenje MS. Pri zdravljenju z INF-beta so se pokazale kot pomembne biološke poti signalna pot interferona tipa 1, celični odgovor na interferon tipa 1 ter odgovor na interferon tipa 1, kar je smiselno glede na samo zdravilo, vendar smo opazili, da te poti vključujejo le malo genov, ki bi lahko sodelovali pri odzivu. Pri zdravljenju z GA pa so ključne biološke poti imunski odziv, proces imunskega sistema ter citokine signalne poti. Gene povezane z odzivom na zdravljenje smo povezali v mrežo, s katero smo dobili vpogled v proteinsko povezavo med posameznimi geni. Iz mrež je razvidno veliko več povezav kot smo pričakovali, kar pomeni, da imajo proteini več interakcij sami med seboj kot bi to pričakovali od naključnega seta. Poleg tega so geni, povezani z odzivom na zdravljene z določenim biološkim zdravilom, prav tako vključeni še v druge biološke poti povezane s sami imunskim sistemom in njegovo kompleksnostjo.
Ključne besede:multipla skleroza, zdravljenje MS, biološka zdravila, INF-beta, GA, humana monoklona protitelesa, genska ontologija, GWA študije
Leto izida:2019
Kraj izvedbe:Maribor
Založnik:[S. Stokić]
Št. strani:VIII, 55 str.
Izvor:Maribor
UDK:575.111(043.2)
COBISS_ID:22600214 Novo okno
NUK URN:URN:SI:UM:DK:ZSJVVMIY
Število ogledov:545
Število prenosov:40
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
Področja:KTFMB - FKKT
:
  
Skupna ocena:(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
Objavi na:AddThis
AddThis uporablja piškotke, za katere potrebujemo vaše privoljenje.
Uredi privoljenje...

Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Licence

Licenca:CC BY-NC-ND 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva-Nekomercialno-Brez predelav 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.sl
Opis:Najbolj omejujoča licenca Creative Commons. Uporabniki lahko prenesejo in delijo delo v nekomercialne namene in ga ne smejo uporabiti za nobene druge namene.
Začetek licenciranja:13.08.2019

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Analyis of biological pathway s with response to biological therapy in patients with multiple sclerosis using tolls of gene ontology
Opis:Multiple sclerosis (MS) is a chronic autoimmune disease of the central nervous system. Epidemiologic data show that environmental and genetic factors play a key role in the development of MS. Current MS treatments include immunomodulatory and immunosuppressive drugs and monoclonal antibodies. The most frequently used therapies are interferon- beta (INF-beta) and glatiramer acetate (GA). The response to therapy differs among individuals and around 30-50 % patients doesn't respond. Although the reason is yet unknown many studies showed the role of genetics in treatment response. It is important to find biomarkers to identify likely responders and/or those who may have treatment-limiting adverse reactions. In this work we focused on pharmacogenomic studies with INF-beta and GA in RRMS patients. In analysis we included studies that were investigating associations between genetic variation and treatment response. In next phases with use of bioinformatics tools and gene ontology we tried to find biological mechanisms which predict response to pharmacological treatment of MS. With use of interaction networks we tried to demonstrate interaction between the proposed genes. Our research showed the most significant biological processes in INF-beta treatment are type I interferon signaling pathway, cellular response to type I interferon, response to type I interferon. In GA treatment the most significant biological processes are immune response, immune system process, cytokine-mediated signaling pathway. Interaction networks showed more interactions among chosen genes than what would be expected for a random set of proteins of similar size, drawn from the genome. Such an enrichment indicates that the proteins are at least partially biologically connected, as a group. And also that many genes that indicate response to treatment are involved also in other biological pathways in complex immune system.
Ključne besede:multiple sclerosis, MS treatment, biologicals, INF-beta, GA, humanized monoclonal antibodies, gene ontology, GWAS


Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj
Logotipi partnerjev Univerza v Mariboru Univerza v Ljubljani Univerza na Primorskem Univerza v Novi Gorici