| | SLO | ENG | Piškotki in zasebnost

Večja pisava | Manjša pisava

Izpis gradiva

Naslov:Evolucijski algoritem za poravnavo sekvenc
Avtorji:Bureković, Adel (Avtor)
Bošković, Borko (Mentor) Več o mentorju... Novo okno
Brest, Janez (Komentor)
Datoteke:.pdf MAG_Burekovic_Adel_2018.pdf (1,30 MB)
 
Jezik:Slovenski jezik
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga (mb22)
Tipologija:2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:FERI - Fakulteta za elektrotehniko, računalništvo in informatiko
Opis:Poravnava bioloških sekvenc je računsko kompleksen problem, pri katerem skušamo z različnimi pristopi pridobiti čim bolj optimalno poravnavo. Namen magistrskega dela je bil predstaviti reševanje problema poravnave bioloških sekvenc s pomočjo evolucijskega algoritma. Ker je problem lahko časovno zahteven, smo algoritem implementirali s programskim jezikom C++. Naš algoritem smo primerjali s programskim orodjem Clustal X na skupinah sekvenc DNK in skupinah sekvenc proteinov, ki smo jih pridobili iz podatkovne baze BAliBase. Z našim algoritmom smo se v nekaterih primerih dokaj približali rezultatom programskega orodja Clustal X.
Ključne besede:evolucijski algoritem, poravnava sekvenc DNK, poravnava sekvenc proteinov
Leto izida:2018
Založnik:A. Bureković
Izvor:[Maribor
UDK:004.021:575.82(043.2)
COBISS_ID:21805590 Povezava se odpre v novem oknu
NUK URN:URN:SI:UM:DK:CABADFU1
Licenca:CC BY-NC-ND 4.0
To delo je dosegljivo pod licenco Creative Commons Priznanje avtorstva-Nekomercialno-Brez predelav 4.0 Mednarodna
Število ogledov:232
Število prenosov:155
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
Področja:KTFMB - FERI
:
  
Skupna ocena:(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
Objavi na:AddThis
AddThis uporablja piškotke, za katere potrebujemo vaše privoljenje.
Uredi privoljenje...

Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:An evolutionary algorithm for sequence alignment
Opis:Sequence alignment of biological sequences is a computationaly complex problem where we try to achieve the most optimal sequence alignment with different approaches. In this thesis we introduce multiple sequence alignment method with evolutionary algorithm. Our algorithm is written in C++ programming language for optimization purposes. We compared alignment results of our implementation with Clustal X program on dataset of different DNA and protein sequences that we have found in BAliBase database. In some cases we have found that results of our algorithm are quite comparable to Clustal X program.
Ključne besede:evolutionary algorithm, DNA sequence alignment, protein sequence alignment


Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj
Logotipi partnerjev Univerza v Mariboru Univerza v Ljubljani Univerza na Primorskem Univerza v Novi Gorici