1. Partial vs. superficial parotidectomy for surgical treatment of pleomorphic adenoma of the parotid glandBogdan Čizmarevič, Boštjan Lanišnik, Dejan Dinevski, 2019, izvirni znanstveni članek Ključne besede: delna parotidektomija, superfacialna parotidektomija, pleomorfni adenom, Freyev sindrom, ponovitev bolezni, okvara obraznega živca
Objavljeno v DKUM: 05.04.2024; Ogledov: 193; Prenosov: 13
 Celotno besedilo (219,27 KB)
Gradivo ima več datotek! Več...
Gradivo je zbirka in zajema 1 gradivo! |
2. Early detection of neck lymph node metastases in breast cancer patients : the role of ultrasound and fine needle biopsyJanez Rebol, Peter Balon, Peter Kokol, Boštjan Lanišnik, Iztok Takač, Andraž Dovnik, Nina Fokter Dovnik, Monika Sobočan, Darja Arko, 2019, izvirni znanstveni članek Ključne besede: metastases, neck lymph, ultrasound, fine needle biopsy, breast canser
Objavljeno v DKUM: 27.03.2024; Ogledov: 225; Prenosov: 6
Celotno besedilo (129,81 KB)
Gradivo ima več datotek! Več...
Gradivo je zbirka in zajema 1 gradivo! |
3. Vloga dolge nekodirajoče rna inc-fanci-2 pri raku glave in vratuJure Šuster, 2023, diplomsko delo Opis: Rak glave in vratu (angl. Head and Neck Cancer, HNC) predstavlja raznoliko skupino rakov, med katere uvrščamo rake ustne votline in ustnic, nosa in obnosne votline, grla, žrela ter žlez slinavk. Po ocenah iz leta 2016 je bilo na svetu evidentiranih 4,1 miliona vseh primerov HNC, kar ga uvršča na sedmo mesto najpogostejših rakov. Letno zaradi HNC umre okoli 500.000 ljudi. Najpogostejši dejavnik tveganja za nastanek HNC sta kajenje in prekomerno uživanje alkohola. Vse pogosteje pa nastanek HNC, predvsem rake srednjega dela žrela, povezujejo z okužbo z onkogenimi serotipi človeških papilomavirusov (HPV). Nedavno nazaj so ugotovili, da okužba s HPV16 poviša izražanje dolge nekodirajoče RNA (lnc RNA) lnc-FANCI-2 pri raku na materničnem vratu. Da bi ugotovili, ali je mehanizem onkogenega delovanja HPV16 ohranjen med raki materničnega vratu in HNC, smo v diplomski nalogi z metodo RT-qPCR proučili izražanje prepisov lnc-FANCI-2 dA1 in dA2 in lokusa MIR9-3HG, ki zraven izooblik lnc-FANCI-2 kodira še druge nekodirajoče RNA, pri bolnikih s ploščato celičnim karcinomom glave in vratu (angl. Head and Neck Squamous Cell Carcinoma, HNSCC), okuženih s HPV16. Skupno gledano je bilo Izražanje MIR9-3HG višje (p< 0,01) v tumorjih kot zdravem tkivu, razlika pa se je ohranila (p< 0,05) tudi pri rakih žrela. HPV16 (+) tumorji so kazali nižje (p< 0,05) izražanje MIR9-3HG v primerjavi s HPV16 (-) tumorji, kar kaže, da okužba s HPV16 zavira izražanje lokusa MIR9-3HG. Za razliko od okužbe s HPV16 pa vpliva dejavnikov tveganja kajenja in uživanja alkohola na izražanje MIR9-3HG nismo ugotovili. Izražanje MIR9-3HG se ni razlikovalo med tumorji s perivaskularno, perinevralno ali limfovaskularno invazijo in tumorji brez invazije. Razširjeni tumorji z zasevki v lokalnih bezgavkah (cN1+, pN1+) so kazali nižje izražanje MIR9-3HG v primerjavi s tumorji brez zasevkov (cN0, pN0), vendar razlika ni dosegla statistične značilnosti. Izražanje MIR9-3HG se ni razlikovalo glede na velikost tumorja (cT1-cT4, pT1-pT4). Izražanja prepisov lnc-FANCI-2 dA1 in dA2 na proučevanem vzorcu bolnikov nismo potrdili.
Rezultati naše naloge kažejo na vlogo lokusa MIR9-3HG pri nastanku HNSCC v prisotnsoti okužbe s HPV16. Ali pri tem sodelujejo tudi izooblike lnc-FANCI-2 ni znano in bo njihovo vlogo v tumorigenezi HNSCC v nadaljevanju potrebno še proučiti.
Ključne besede: rak glave in vratu, MIR9-3HG, lnc FANCI-2, HPV16, RT-qPCR
Objavljeno v DKUM: 09.11.2023; Ogledov: 409; Prenosov: 36
Celotno besedilo (2,17 MB) |
4. Izražanje genov za DNA in RNA metilaze in demetilaze pri bolnikih z rakom glave in vratu : diplomsko delo visokošolskega strokovnega študijskega programa I. stopnjeKarmen Zorič, 2022, diplomsko delo Opis: Letna incidenca raka glave in vratu (RGV, angl. Head and Neck cancer, HNC) znaša okoli 700 000 novo odkritih primerov po celotnem svetu, kar ga izmed vseh bolezni uvršča na šesto mesto. Najpogostejša oblika RGV je ploščatocelični karcinom, ki predstavlja 85 % vseh primerov RGV. Za RGV so značilni različni simptomi, ki tudi pomagajo pri odkrivanju bolezni. Zdravljenje temelji na določitvi stopnje napredovanja bolezni. Epigenetske spremembe, kot sta DNA in RNA metilacija, spadajo med značilne spremembe karcinoma. Ker je ekspresija genov metilaz in demetilaz v tkivih RGV še vedno slabo raziskana, smo v sklopu diplomskega dela v tkivih bolnikov RGV dodatno proučili gensko ekspresijo nabora DNA in RNA metilaz in demetilaz ter njihovo ekspresijo povezali s klinično patološkimi značilnostmi tumorjev glave in vratu ter jih izkoristili za napoved razvoja, zdravljenja in ponovitve bolezni.
Tako smo v zdravem in tumorskem tkivu 34 bolnikov z rakom glave in vratu, s pomočjo metode RT-qPCR, proučili izražanje genov DNMT1, DNMT3A, DNMT3B, TET1, TET2, TET3 in TRDMT1.
Ugotovili smo povezavo med izražanjem TRDMT1, kliničnimi parametri in dejavniki tveganja, vključno z mestom nastanka tumorja, kadilskim statusom, uživanjem alkohola ter HPV okužbo. Stopnja izražanja TRDMT1 je bila povezana z napredovanjem/agresivnostjo bolezni, in sicer se z znižanjem TRDMT1 stopnja napredovanja agresivnosti viša. Pri analizi izražanja DNA metilaz in demetilaz v odvisnosti od prisotnosti ali odsotnosti zasevkov v področnih bezgavkah v tumorskem tkivu smo ugotovili trend povišanega izražanja DNA metilaz in demetilaz v zgodnjih stadijih ter trend znižanega izražanja DNA metilaz in demetilaz v poznih stadijih.
V ta namen bi bilo smiselno raziskavo razširiti na večje število vzorcev, s čimer bi se posledično povečala statistična moč analize, ki bi lahko prispevala k razjasnitvi vloge izražanja DNA in RNA metilaz ter demetilaz kot potencialnih kazalcev za klasifikacijo bolnikov in določitev ocene napredovanja bolezni.
Ključne besede: rak glave in vratu, metilaze, demetilaze, relativna genska ekspresija, tumorsko tkivo
Objavljeno v DKUM: 13.09.2022; Ogledov: 605; Prenosov: 84
Celotno besedilo (3,48 MB) |
5. An evaluation of SOX2 and hTERC gene amplifications as screening markers in oral and oropharyngeal squamous cell carcinomasNadja Kokalj-Vokač, Bogdan Čizmarevič, Andreja Zagorac, Boris Zagradišnik, Boštjan Lanišnik, izvirni znanstveni članek Opis: Background: Oral and oropharyngeal squamous cell carcinomas (OSCC) are among the most common cancers. The poor survival rate among oral cancer patients can be attributed to several factors, one of them being lack of early detection. A key approach to this problem would be to detect potentially malignant lesion at their early stage. Using the FISH technique, oral brush cytology slides can be an easy and rapid screening approach for malignant cell detection. The present study was designed to detect hTERC and SOX2 amplifications in OSSC exfoliative tumor cells and evaluate whether those two gene amplifications might serve as a supportive biomarker in early detection and diagnosis of oral and oropharyngeal SCC.
Results: Brush biopsies were collected from exophytic and exulcerated oral and oropharyngeal lesions of the oral cavity of 71 patients and 22 healthy controls. FISH techniques using a TERC-specific DNA probe and a SOX2 DNA specific probe both combined with a centromere 3-specific control probe was performed on the cytology slides. A 100 squamous epithelial cell nuclei of the smears per slide were analysed. As abnormal FISH pattern were considered amplified and polyploid patterns. From 71 brush biopsies of oropharynx and other locations in oral cavity analysed by FISH 49 were considered to be abnormal (69%). The over representation of polyploidy and/or TERC/SOX2 amplification in tumour samples was statistically significant when compared to controls (p = 0.01).
Conclusion: SOX2 and TERC gene amplifications are common in all squamous cell carcinomas and their detection in early stages could be crucial for early detection and more accurate prognosis. Our study strongly suggests that early detection by FISH on cytobrushed samples could be a possible non-invasive screening method even before a tissue biopsy is performed.
Ključne besede: SOX and hTERC gene amplifications, brush biopsy, Oral, oropharyngeal squamous cell carcinoma
Objavljeno v DKUM: 29.06.2017; Ogledov: 1403; Prenosov: 401
Celotno besedilo (1,28 MB)
Gradivo ima več datotek! Več... |
