| | SLO | ENG | Piškotki in zasebnost

Večja pisava | Manjša pisava

Iskanje po katalogu digitalne knjižnice Pomoč

Iskalni niz: išči po
išči po
išči po
išči po
* po starem in bolonjskem študiju

Opcije:
  Ponastavi


1 - 6 / 6
Na začetekNa prejšnjo stran1Na naslednjo stranNa konec
1.
2.
Design of Tetra-Peptide Ligands of Antibody Fc Regions Using In Silico Combinatorial Library Screening
Marko Jukič, Sebastjan Kralj, Anja Kolarič, Urban Bren, 2023, izvirni znanstveni članek

Opis: Abstract Peptides, or short chains of amino-acid residues, are becoming increasingly important as active ingredients of drugs and as crucial probes and/or tools in medical, biotechnological, and pharmaceutical research. Situated at the interface between small molecules and larger macromolecular systems, they pose a difficult challenge for computational methods. We report an in silico peptide library generation and prioritization workflow using CmDock for identifying tetrapeptide ligands that bind to Fc regions of antibodies that is analogous to known in vitro recombinant peptide libraries’ display and expression systems. The results of our in silico study are in accordance with existing scientific literature on in vitro peptides that bind to antibody Fc regions. In addition, we postulate an evolving in silico library design workflow that will help circumvent the combinatorial problem of in vitro comprehensive peptide libraries by focusing on peptide subunits that exhibit favorable interaction profiles in initial in silico peptide generation and testing.
Ključne besede: peptide design, in silico combinatorial library, peptide combinatorial library, peptide library design, high-throughput virtual screening, peptide molecular docking, antibody purification, peptide drug design, recombinant peptide libraries
Objavljeno v DKUM: 01.12.2023; Ogledov: 189; Prenosov: 11
.pdf Celotno besedilo (8,11 MB)
Gradivo ima več datotek! Več...

3.
Iskanje novih zaviralcev, ki preprečujejo vezavo SARS-CoV-2 na neuropilin 1 : magistrsko delo
Zala Serianz, 2023, magistrsko delo

Opis: Neuropilin 1 je eden najpomembnejših koreceptorjev vaskularnega endotelijskega rastnega faktorja A. Vključen je v številne fiziološke in patološke procese, med drugim sodeluje pri vezavi virusa SARS-CoV-2. Zaradi nujne potrebe po inovativnih strategijah boja proti virusu SARS-CoV-2 je magistrsko delo usmerjeno na računalniško pot odkrivanja potencialnih zaviralcev neuropilina 1 za preprečevanje vezave virusa SARS-CoV-2. Za uporabo tandemskega pristopa farmakofornega modeliranja in virtualnega rešetanja smo uporabili znano kristalno strukturo neuropilina 1 v kompleksu z zaviralcem EG01377 ter uveljavljene aktivne spojine iz znanstvene literature z določeno stopnjo zaviranja vezave različnih ligandov na neuropilin 1, s čimer smo pridobili dva različna farmakoforna modela. Z uporabo teh modelov pri virtualnem rešetanju smo uspešno identificirali 20 spojin zadetkov kot potencialnih zaviralcev neuropilina 1, ki bi jih bilo potrebno eksperimentalno preveriti za potrditev njihove vezavne afinitete in aktivnosti. Identificirane spojine smo primerjali z že znanimi aktivnimi spojinami za boljši vpogled v njihove strukturne podobnosti in z njimi povezane interakcije ligand-neuropilin 1.
Ključne besede: Neuropilin 1, SARS-CoV-2, zaviralci, farmakoforno modeliranje, virtualno rešetanje
Objavljeno v DKUM: 24.11.2023; Ogledov: 334; Prenosov: 40
.pdf Celotno besedilo (5,32 MB)

4.
Neuropilin (NRPs) related pathological conditions and their modulators
Matic Broz, Anja Kolarič, Marko Jukič, Urban Bren, 2022, pregledni znanstveni članek

Opis: Neuropilin 1 (NRP1) represents one of the two homologous neuropilins (NRP, splice variants of neuropilin 2 are the other) found in all vertebrates. It forms a transmembrane glycoprotein distributed in many human body tissues as a (co)receptor for a variety of different ligands. In addition to its physiological role, it is also associated with various pathological conditions. Recently, NRP1 has been discovered as a coreceptor for the SARS-CoV-2 viral entry, along with ACE2, and has thus become one of the COVID-19 research foci. However, in addition to COVID-19, the current review also summarises its other pathological roles and its involvement in clinical diseases like cancer and neuropathic pain. We also discuss the diversity of native NRP ligands and perform a joint analysis. Last but not least, we review the therapeutic roles of NRP1 and introduce a series of NRP1 modulators, which are typical peptidomimetics or other small molecule antagonists, to provide the medicinal chemistry community with a state-of-the-art overview of neuropilin modulator design and NRP1 druggability assessment.
Ključne besede: neuropilins, computer-aided drug design, in silico drug design, receptor modulator design, peptidomimetics, small-molecule antagonists, cancer, COVID-19, neuropathic pain
Objavljeno v DKUM: 22.08.2023; Ogledov: 212; Prenosov: 24
.pdf Celotno besedilo (11,93 MB)
Gradivo ima več datotek! Več...

5.
KONFLIKT VREDNOT KOT ODRAZ BRITANSKE DRUŽBE V 1960H LETIH V ROMANU THE MILLSTONE AVTORICE MARGARET DRABBLE
Anja Kolarič, 2016, diplomsko delo

Opis: Predmet te diplomske naloge je roman The Millstone avtorice Margaret Drabble. Po žanru delo sodi med ženske vzgojne romane in njegova glavna tematika je materinstvo. Njegova protagonistka je Rosamund Stacey, dobro izobraženo dekle, katere starši so socialisti in pripadajo srednjemu družbenemu sloju, in katera po enem samem spolnem odnosu zanosi ter se odloči, da bo otroka vzgajala sama. Družbene, zgodovinske in biografske okoliščine, ki so vplivale na avtorico, se v knjigi močno odražajo. Glavni poudarek je na prizadevanju glavne junakinje po neodvisnosti, na njeni izkušnji materinstva in notranjih konfliktih, ki izvirajo iz nesoglasij med tradicionalnimi in liberalnimi vrednotami tistega obdobja. Da bi dosegla cilj, sem preučila avtoričino profesionalno in zasebno plat življenja, zgodovinske in družbene okoliščine obobja šestdesetih, še posebno pa fabianizem, feministična gibanja ter britanski nacionalni zdravstveni sistem (NHS). Na podlagi ugotovitev je bila narejena analiza besedila, ki je pokazala, da je neodvisnot glavne junakinje dvoumna in, da je materinstvo v njej sprožilo spremembo nazorov. Posledično protagonistka postane bolj prepričana vase, realna v svojih nazorih in njene vrednote odražajo angleško moralo tistega obdobja. Dejstvo, da izhaja iz srednjega družbenega sloja, ji pomaga premagati družbeno zaznamovanost kot neporočena mati, poleg tega pa ji njena uspešna in obetavna kariera pomaga, da ostane zbrana in lažje premaguje izzive skozi celotno izkušnjo.
Ključne besede: Margaret Drabble, materinstvo, ženski vzgojni roman, družbeni, zgodovinski in biografski vplivi, neodvisnost, srednji družbeni sloj, fabianizem, feministična gibanja, akademska kariera, nacionalni zdravstveni sistem (NHS)
Objavljeno v DKUM: 11.11.2016; Ogledov: 1302; Prenosov: 93
.pdf Celotno besedilo (1,06 MB)

6.
Iskanje izvedeno v 13.56 sek.
Na vrh
Logotipi partnerjev Univerza v Mariboru Univerza v Ljubljani Univerza na Primorskem Univerza v Novi Gorici