Abstract: V magistrskem delu smo implementirali platformo za varno izvajanje naloženih evolucijskih algoritmov. Uporabnikom omogoča, da naložijo programsko kodo, katera se neodvisno, brez interneta zažene v zabojniku. Z zabojnikom dosežemo zelo veliko varnost gostitelja, saj po vsakem zaključku naložene programske kode pobrišemo tako zabojnike kot vse procese, povezane z njim. Po zaključnem zagonu naložene programske kode zna platforma pravilno razvrstiti naloženo kodo v mape, ločiti med predolgimi zagoni, pravilnimi zagoni in zagoni z nepravilnimi rezultati. Natančno smo opisali uporabljene tehnologije in postopke implementacije ter opravili test odzivnosti sistema ob velikih obremenitvah.Keywords: docker, EARS, evolucijski algoritmi, izvajalno okolje, programerska tekmovanjaPublished in DKUM: 24.11.2022; Views: 516; Downloads: 74 Full text (2,59 MB)
Abstract: V diplomskem delu smo implementirali algoritem za optimizacijo zvijanja proteinov znotraj modela HP. Algoritem na centralno procesni enoti porabi veliko časa, da protein zvije v optimalno strukturo. Zato smo algoritem prilagodili, da se izvaja na grafični procesni enoti. Učinkovitost algoritma smo analizirali na znanih sekvencah iz literature. S pomočjo algoritma, ki se je izvajal na grafični procesni enoti smo v povprečju dosegli 10,2 - kratno pohitritev v primerjavi z algoritmom, ki se izvaja na centralno procesni enoti.Keywords: zvijanje proteinov, CUDA, optimizacija, evolucijski algoritemPublished in DKUM: 03.11.2020; Views: 1158; Downloads: 101 Full text (748,33 KB)