| | SLO | ENG | Piškotki in zasebnost

Večja pisava | Manjša pisava
Prva stran > Izpis gradiva

Izpis gradiva Pomoč

Naslov:Identification of novel loci involved in adalimumab response in Crohn’s disease patients using integration of genome profiling and isoform-level immune-cell deconvoluted transcriptome profiling of colon tissue
Avtorji:ID Gorenjak, Mario (Avtor)
ID Jezernik, Gregor (Avtor)
ID Krušič, Martina (Avtor)
ID Skok, Pavel (Avtor)
ID Potočnik, Uroš (Avtor)
Datoteke:.pdf Gorenjak_2022_Identification_of_Novel_Loci_Involved.pdf (1,65 MB)
MD5: FB8DF46C9A5621E82619426E782CB8F4
 
URL https://doi.org/10.3390/pharmaceutics14091893
 
Jezik:Angleški jezik
Vrsta gradiva:Znanstveno delo
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:MF - Medicinska fakulteta
FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
Opis:Crohn’s disease is a consequence of dysregulated inflammatory response to the host’s microbiota. Although anti-TNF treatment improves the quality of the patient’s life, a large proportion of patients lose response to the treatment. The past decade of research has led to a continuum of studies showcasing the heterogeneity of anti-TNF response; thus, the aim of the present study was to dissect transcriptome-wide findings to transcript isoform specific levels and combine the analyses with refined information of immune cell landscapes in colon tissue, and subsequently select promising candidates using gene ontology and genomic integration. We enrolled Slovenian Crohn’s disease patients who were naïve with respect to adalimumab treatment. We performed colon tissue RNA sequencing and peripheral blood mononuclear cell DNA genotyping with a subsequent contemporary integrative approach to combine immune cell deconvoluted isoform transcript specific transcriptome analysis, gene ontology layering and genomic data. We identified nine genes (MACF1, CTSE, HDLBP, HSPA9, HLA-DMB, TAP2, LGMN, ANAPC11, ACP5) with 15 transcripts and 16 variants involved in the adalimumab response. Our study identified loci, some of which were previously shown to contribute to inflammatory bowel disease susceptibility, as novel loci involved in adalimumab response in Crohn’s disease patients.
Ključne besede:Crohn’s disease, adalimumab, transcriptome, isoforms, deconvolution
Status publikacije:Objavljeno
Verzija publikacije:Objavljena publikacija
Poslano v recenzijo:10.08.2022
Datum sprejetja članka:02.09.2022
Datum objave:07.09.2022
Založnik:MDPI
Leto izida:2022
Št. strani:Str. 1-16
Številčenje:Letn. 14, št. 9, št. članka 1893
PID:20.500.12556/DKUM-91257 Novo okno
UDK:616.3
COBISS.SI-ID:120609795 Novo okno
DOI:10.3390/pharmaceutics14091893 Novo okno
ISSN pri članku:1999-4923
Datum objave v DKUM:05.12.2024
Število ogledov:0
Število prenosov:4
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
Področja:Ostalo
:
GORENJAK, Mario, JEZERNIK, Gregor, KRUŠIČ, Martina, SKOK, Pavel in POTOČNIK, Uroš, 2022, Identification of novel loci involved in adalimumab response in Crohn’s disease patients using integration of genome profiling and isoform-level immune-cell deconvoluted transcriptome profiling of colon tissue. Pharmaceutics [na spletu]. 2022. Vol. 14, no. 9,  članka 1893, p. 1–16. [Dostopano 6 april 2025]. DOI 10.3390/pharmaceutics14091893. Pridobljeno s: https://dk.um.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&id=91257
Kopiraj citat
  
Skupna ocena:
0.5
1
1.5
2
2.5
3
3.5
4
4.5
5
(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
Objavi na:Bookmark and Share


Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Gradivo je del revije

Naslov:Pharmaceutics
Skrajšan naslov:Pharmaceutics
Založnik:MDPI
ISSN:1999-4923
COBISS.SI-ID:517949977 Novo okno

Gradivo je financirano iz projekta

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P3-0427
Naslov:Sistemski pristopi k raziskavam človeškega genoma za personalizirano medicino kroničnih imunskih bolezni
Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J3-9258
Naslov:Molekularno genetski biooznačevalci in mehanizmi neodzivnosti na biološko zdravljenje zanti-TNF bolnikov s kroničnimi imunskimi boleznimi

Licence

Licenca:CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.
Začetek licenciranja:07.09.2022

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:Crohnova bolezen, adalimumab, transkriptom, izoforme, dekonvolucija


Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj
Logotipi partnerjev Univerza v Mariboru Univerza v Ljubljani Univerza na Primorskem Univerza v Novi Gorici