| | SLO | ENG | Piškotki in zasebnost

Večja pisava | Manjša pisava
Prva stran > Izpis gradiva

Izpis gradiva Pomoč

Naslov:Maksimalna produkcija entropije in maksimalna shannonova informacijska entropija v encimski kinetiki
Avtorji:ID Šterk, Marko (Avtor)
ID Dobovišek, Andrej (Mentor) Več o mentorju... Novo okno
ID Markovič, Rene (Komentor)
Datoteke:.pdf MAG_Sterk_Marko_2018.pdf (773,67 KB)
MD5: 1683EA9F922C6931E96FB30308A473BC
PID: 20.500.12556/dkum/fae737f0-74dc-469e-923d-f91d8ab050e6
 
Jezik:Slovenski jezik
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga
Tipologija:2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:FNM - Fakulteta za naravoslovje in matematiko
Opis:Princip maksimalne produkcije entropije je osrednji optimizacijski princip neravnovesne termodinamike. Princip je dobro raziskan in uveljavljen v sistemih, kjer je zveza med silami in tokovi linearna. Za sisteme, kjer je ta zveza nelinearna pa princip še ni povsem uveljavljen. Primer sistema, kjer je zveza med silami in tokovi nelinearna, so encimske reakcije. V tem magistrskem delu z uporabo principa maksimalne produkcije entropije analiziramo encimsko reakcijo, ki jo poganja encim trioza-fosfat izomeraza, ki je pomemben člen v procesu glikolize in s tem pri proizvodnji energije v večini organizmov. Encim poganja reverzibilno reakcijo v kateri pretvarja substrat dihidroksi acetonfosfat v gliceraldehid-3-fosfat preko vmesnega člena iz skupine enediolov. Z upoštevanjem zakona o ohranitvi mase sistema, ohranitvi encima in fiksne ravnovesne konstante reakcije pokažemo, da v neravnovesnem stacionarnem stanju sistema obstaja maksimum produkcije entropije v odvisnosti od poljubno izbrane kinetične konstante encima. Pokazano je tudi, da v stanju z maksimalno produkcijo entropije soobstajata maksimuma Shannonove informacijske entropije in kinetične fleksibilnosti, kar pomeni, da je stanje z maksimalno produkcijo entropije hkrati tudi najverjetnejše stacionarno stanje, v katerem je encim najfleksibilnejši. Tako napovedane optimalne kinetične konstante encima trioza-fosfat izomeraza primerjamo z eksperimentalno določenimi vrednostmi iz literature in s teoretičnimi napovedmi, ki so jih podali drugi raziskovalci z uporabo svojih optimizacijskih metod.
Ključne besede:trioza-fosfat izomeraza, encimska kinetika, produkcija entropije, informacijska entropija, kinetična fleksibilnost
Kraj izida:Maribor
Založnik:[M. Šterk]
Leto izida:2018
PID:20.500.12556/DKUM-72042 Novo okno
UDK:536.75(043.2)
COBISS.SI-ID:24106504 Novo okno
NUK URN:URN:SI:UM:DK:QMQNYB2M
Datum objave v DKUM:04.02.2021
Število ogledov:1281
Število prenosov:71
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
Področja:FNM
:
ŠTERK, Marko, 2018, Maksimalna produkcija entropije in maksimalna shannonova informacijska entropija v encimski kinetiki [na spletu]. Magistrsko delo. Maribor : M. Šterk. [Dostopano 6 april 2025]. Pridobljeno s: https://dk.um.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&id=72042
Kopiraj citat
  
Skupna ocena:
0.5
1
1.5
2
2.5
3
3.5
4
4.5
5
(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
Objavi na:Bookmark and Share


Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Licence

Licenca:CC BY-NC-ND 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva-Nekomercialno-Brez predelav 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.sl
Opis:Najbolj omejujoča licenca Creative Commons. Uporabniki lahko prenesejo in delijo delo v nekomercialne namene in ga ne smejo uporabiti za nobene druge namene.
Začetek licenciranja:07.09.2018

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Maximum entropy production and maximum shannon information entropy in enzyme kinetics
Opis:The maximum entropy production principle is an optimization principle in non-equilibrium thermodynamics. The principle is well established and accepted for systems in which the relationship between fluxes and forces is linear. However, it is still not clear if the principle is valid for systems with non-linear force-flux relationships. Enzyme reactions are examples of such non-linear systems. In this master thesis we apply the maximum entropy production principle to the reaction catalysed by the enzyme triosephosphate isomerase which is an important enzyme in the glycolysis process and thus for energy production in most organisms. The enzyme catalyses the reversible interchange of dihydroxy acetonphosphate to glyceraldehyde-3-phosphate with an enediol intermediate. Under the constraints of mass conservation, enzyme conservation and a fixed equilibrium constant of the reaction we show that a maximum in entropy production in a steady state exists as a function of an arbitrary chosen enzyme rate constant. Moreover, we show that in the state of maximum entropy production maxima of Shannon information entropy and kinetic flexibility coexist. This means that the steady state with a maximum in entropy production is also the most probable steady state in which the enzyme is most flexible. We compare the optimal enzyme rate constants calculated by this method with experimentally observed values as well as with values from the literature published by other authors.
Ključne besede:triosephosphate isomerase, enzyme kinetics, entropy production, information entropy, kinetic flexibility


Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj
Logotipi partnerjev Univerza v Mariboru Univerza v Ljubljani Univerza na Primorskem Univerza v Novi Gorici