| | SLO | ENG | Piškotki in zasebnost

Večja pisava | Manjša pisava
Prva stran > Izpis gradiva

Izpis gradiva Pomoč

Naslov:Typing Clostridium difficile strains based on tandem repeat sequences
Avtorji:ID Henning Zaiß, N (Avtor)
ID Rupnik, Maja (Avtor)
ID Kuijper, Ed J (Avtor)
ID Harmanus, Celine (Avtor)
ID Michielsen, Dolf (Avtor)
ID Janssens, Koen (Avtor)
ID Nübel, Ulrich (Avtor)
Datoteke:.pdf BMC_Microbiology_2009_ZaiSS_et_al._Typing_Clostridium_difficile_strains_based_on_tandem_repeat_sequences.pdf (792,24 KB)
MD5: 7935102399729F22747BA7836244BE54
 
URL http://bmcmicrobiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2180-9-6
 
Jezik:Angleški jezik
Vrsta gradiva:Znanstveno delo
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:MF - Medicinska fakulteta
Opis:Background: Genotyping of epidemic Clostridium difficile strains is necessary to track their emergence and spread. Portability of genotyping data is desirable to facilitate inter-laboratory comparisons and epidemiological studies. Results: This report presents results from a systematic screen for variation in repetitive DNA in the genome of C. difficile. We describe two tandem repeat loci, designated 'TR6' and 'TR10', which display extensive sequence variation that may be useful for sequence-based strain typing. Based on an investigation of 154 C. difficile isolates comprising 75 ribotypes, tandem repeat sequencing demonstrated excellent concordance with widely used PCR ribotyping and equal discriminatory power. Moreover, tandem repeat sequences enabled the reconstruction of the isolates' largely clonal population structure and evolutionary history. Conclusion: We conclude that sequence analysis of the two repetitive loci introduced here may be highly useful for routine typing of C. difficile. Tandem repeat sequence typing resolves phylogenetic diversity to a level equivalent to PCR ribotypes. DNA sequences may be stored in databases accessible over the internet, obviating the need for the exchange of reference strains.
Ključne besede:Clostridium difficile, microbiology, strain typing
Status publikacije:Objavljeno
Verzija publikacije:Objavljena publikacija
Leto izida:2009
Št. strani:str. 1-11
Številčenje:Letn. 9
PID:20.500.12556/DKUM-66508 Novo okno
ISSN:1471-2180
UDK:579.6
COBISS.SI-ID:652063 Novo okno
DOI:10.1186/1471-2180-9-6 Novo okno
ISSN pri članku:1471-2180
NUK URN:URN:SI:UM:DK:DFSXNGHG
Datum objave v DKUM:29.06.2017
Število ogledov:1585
Število prenosov:403
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
Področja:Ostalo
:
HENNING ZAISS, N, RUPNIK, Maja, KUIJPER, Ed J, HARMANUS, Celine, MICHIELSEN, Dolf, JANSSENS, Koen in NÜBEL, Ulrich, 2009, Typing Clostridium difficile strains based on tandem repeat sequences. BMC Microbiology [na spletu]. 2009. Vol. 9, p. 1–11. [Dostopano 13 april 2025]. DOI 10.1186/1471-2180-9-6. Pridobljeno s: https://dk.um.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&id=66508
Kopiraj citat
  
Skupna ocena:
0.5
1
1.5
2
2.5
3
3.5
4
4.5
5
(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
Objavi na:Bookmark and Share


Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Gradivo je del revije

Naslov:BMC Microbiology
Skrajšan naslov:BMC Microbiol.
Založnik:BioMed Central
ISSN:1471-2180
COBISS.SI-ID:2441492 Novo okno

Licence

Licenca:CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.
Začetek licenciranja:29.06.2017

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:Clostridium difficile, mikrobiologija, tipizacija sevov


Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj
Logotipi partnerjev Univerza v Mariboru Univerza v Ljubljani Univerza na Primorskem Univerza v Novi Gorici