| | SLO | ENG | Piškotki in zasebnost

Večja pisava | Manjša pisava

Izpis gradiva Pomoč

Naslov:Mikrobiota sapišč pri izbranih vrstah prostoživečih ptic
Avtorji:ID Matjašič, Tjaša (Avtor)
ID Trček, Janja (Mentor) Več o mentorju... Novo okno
ID Janžekovič, Franc (Komentor)
Datoteke:.pdf MAG_Matjasic_Tjasa_2016.pdf (1,78 MB)
MD5: 724725335AED0FD52516BC9E92F05409
 
Jezik:Slovenski jezik
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga
Tipologija:2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:FNM - Fakulteta za naravoslovje in matematiko
Opis:Ptiči so skupina živali, ki naseljuje najrazličnejše habitate in so razširjeni po vsem svetu. Zaradi sposobnosti letenja lahko premagujejo zelo velike razdalje. Ker so potencialni prenašalci patogenih mikroorganizmov, lahko le-te razširjajo po obsežnem geografskem območju. Mikrobiota v ptičjem črevesju, na njihovi koži in v dihalih, vpliva tudi na fiziološko stanje ptic. Informacije o njeni diverziteti so zato pomembne za preprečevanje širjenja patogenih mikroorganizmov, kot tudi za ohranjanje ogroženih vrst ptic. Ptičem smo vzeli brise na treh telesnih območjih: podperut, kloaka in sapišče. Ker je bil eden od ciljev naloge ugotavljanje prisotnosti bakterije Acinetobacter baumannii, smo vzorce nanesli na selektivno gojišče za osamitev te bakterije. Omenjena bakterija je znana povzročiteljica bolnišničnih okužb. V drugem pristopu smo njeno prisotnost ugotavljali neposredno s PCR-pomnoževanjem odseka gena blaOXA-51-like, ki je naravno prisoten v tej bakteriji. Bakterije A. baumannii v vzorčenih ptičih nismo identificirali z nobenim od obeh uporabljenih pristopov. Hkrati smo iz vzorcev, odvzetih iz sapišč, preiskali celokupno kultivabilno bakterijsko mikrobioto. Iz morfološko različnih bakterijskih kolonij smo s precepljanjem pridobili čiste kolonije in jih identificirali na osnovi preiskovanja nukleotidnega zaporedja gena za 16S rRNK. Od skupno 102 bakterijskih izolatov, ki smo jih osamili iz 15 različnih vrst ptic, smo identificirali 69 različnih vrst bakterij, ki so pripadale 22 različnim družinam in štirim različnim deblom. Od tega je 51 % izolatov pripadalo deblu Actinobacteria, 30 % Proteobacteria, 15 % Firmicutes in 4 % Bacteroidetes. Identificirali smo tudi tri potencialno nove vrste bakterij: Aeromicrobium sp. 9H-4, Agromyces sp. 63H-5 in Chryseobacterium sp. 60H-4. Ugotovili smo, da je sapišče ptičev ekološka niša z značilnimi okoljskimi bakterijami. Mikrobiota sapišč žužkojedih ptic je bila revnejša v smislu vrstne pestrosti in deleža zastopanosti posameznih vrst v primerjavi z vsejedimi pticami. Med identificiranimi bakterijami je bilo 13 vrst (18,8 %) oportunističnih za ljudi in sedem (10,1 %) za rastline.
Ključne besede:ptiči, mikrobiota sapišč, prehrana, Acinetobacter baumannii
Kraj izida:Maribor
Založnik:[T. Matjašič]
Leto izida:2016
PID:20.500.12556/DKUM-57094 Novo okno
UDK:598.2:579(043.2)
COBISS.SI-ID:21996040 Novo okno
NUK URN:URN:SI:UM:DK:UFAPZP4E
Datum objave v DKUM:03.03.2016
Število ogledov:1699
Število prenosov:173
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
Področja:FNM
:
MATJAŠIČ, Tjaša, 2016, Mikrobiota sapišč pri izbranih vrstah prostoživečih ptic [na spletu]. Magistrsko delo. Maribor : T. Matjašič. [Dostopano 18 april 2025]. Pridobljeno s: https://dk.um.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&id=57094
Kopiraj citat
  
Skupna ocena:
0.5
1
1.5
2
2.5
3
3.5
4
4.5
5
(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
Objavi na:Bookmark and Share


Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:The microbiota from choanae of selected free living birds species
Opis:Free-living birds are scattered across the world. Because of their mobility (flying) they can conquer great distances and are therefore a potential risk factor when it comes to spreading of pathogenic microorganisms across wide geographical areas. Microbiota of gut, skin and respiratory tract are important for the birds’ health. More detailed knowledge of these microbiomes would be important for prevention of spreading the pathogenic microorganisms and for preserving endangered bird species. We took samples from the area under the wing, from cloaca and choana. One of the goals of our research was isolation of the species Acinetobacter baumannii. First we used a selective medium to search for this well-known causative agent of hospital-acquired infections. We also tried to detect this bacterial species directly through PCR amplification of the naturally present gene blaOXA-51-like in A. baumannii. Neither of the mentioned methods yielded positive results. At the same time we investigated the total cultivable microbiota in samples taken from choana. From morphologically different bacterial colonies we obtained isolates and identified them based on their 16S rRNA gene sequences. From the total number of 102 bacterial isolates, isolated from 15 different bird species, we identified 69 different bacterial species, classified into 22 different families and four different phyla. They belonged to phylum Actinobacteria (51 %), Proteobacteria (30 %), Firmicutes (15 %) and Bacteroidetes (4 %). We also identified three potentially novel bacterial species: Aeromicrobium sp. 9H-4, Agromyces sp. 63H-5 and Chryseobacterium sp. 60H-4. We have found that bird’s choana is an ecological niche with typical environmental bacteria. The choanal microbiota of insectivores was poorer in terms of composition and species richness compared to omnivores. Thirteen (18.8 %) identified bacterial species are possibly opportunistic to humans and seven (10.1 %) to plants.
Ključne besede:birds, choanal microbiota, diet, Acinetobacter baumannii


Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj
Logotipi partnerjev Univerza v Mariboru Univerza v Ljubljani Univerza na Primorskem Univerza v Novi Gorici